De Molenlei vind haar oorsprong ten westen van het gehucht Molenschot in de gemeente Gilze en Rijen. Deze waterloop vormt de benedenloop van verschillende kleine waterlopen in die gemeente.
Vervolgens stroom deze waterloop in noordwestelijke richting en vormt hier de gemeentegrens tussen de gemeente Breda en de Gemeente Oosterhout. Bij het Breepark mondt de Gilzewouwerbeek uit in de Molenlei. Daarna kruist ze de rijksweg A27 in westelijke richting.
De Molenlei vormde vroeger de grens tussen de voormalige gemeente Teteringen de gemeente Ginneken en Bavel. De loop van de oude Molenlei vertoonde op dit deel van het tracé enkele opvallend rechte stukken. Hierdoor was er sprake van een snellere afvoer van het water naar de Ginnekense watermolen nabij het huidige Marga Mincoplein. Het is mogelijk dat het de bovenloop van een natuurlijke beek was die omstreeks 1280 is gekanaliseerd is om de watermolen van extra aandrijving te voorzien.
Deze watermolen werd gebruikt om eikenschors te maken voor de leerlooierijen. Deze runmolen werd ook wel de Schorsmolen genoemd en bestond vermoedelijk al in 1280. Run is een vloeistof die looizuur bevatte en nodig om het leer soepel en duurzaam te maken.
Lei is in de Baronie van Breda een vrij algemene benaming voor kleine waterlopen of beken. Het is woord 'lei' zou kunnen wijzen op een (deels) kunstmatig karakter van de waterloop (leiden, voeren). Deze waterloop had destijds een lengte van zeker 1,5 kilometer.
In het jaar 1637 werd de watermolen vernield. De waterloop mondde vervolgens ten westen van het dorp Ginneken uit in de rivier de Mark ter hoogte van de huidige Burgemeester Serrarislaan.
Na een aantal overstromingen in 1937 in het Ginneken, werd de Molenlei tien jaar later verlegd naar de huidige locatie. Tegenwoordig stroomt de waterloop door Heusdenhout en mondt nabij het revalidatiecentrum uit in de singels.
Andere historische namen (voor delen van) deze waterloop zijn Molenloop, Molenvliet, Molenvloed, Molenwater, Rulle, WaterLei, Lei of Leike, Goorloop,, Hoolloop, Loop of Heren Waterloop
Klik hier voor vergroting Molenlei